(←) предыдущая запись ; следующая запись (→)
И ещё один наш биоинформатический проект длиной 6 лет подъезжает к концу. Полтора года назад я писал, что наша лаборатория выпустила кракена хокомоку — так называется наша база данных паттернов ДНК, узнаваемых регуляторными белками. В тот раз я с разными техническими деталями рассказывал (↑), какая классная у нас получилась 12-я версия. И хвастался, что всё уже фактически готово для публикации 13-й версии.
Я потормозил немного, потом ещё немного, потом ещё… Что подумал по этому поводу Кролик, никто так и не узнал, потому что Кролик был очень воспитанный.
Но в итоге, наконец, мы выпустили очередной апдейт HOCOMOCO (v13) (→). На этот раз мы уже близко к концу нашей работы, потому что человеческих регуляторных белков, для которых паттерн неизвестен, почти не осталось. И есть шанс, что остальные белки просто не имеют фиксированного паттерна.
В общем, ура, товарищи!!!
Почему я говорю, что проект подъезжает к концу? Потому что нынешний апдейт является лишь побочным продуктом работы большого консорциума, в котором мы «паровозили» биоинформатическую часть.
Три месяца назад мы выложили трамвайчик из пяти статей (→) на bioRxiv и ждём рецензий. Потом нам наверняка ещё предстоит что-то доделывать, и это может занять сколь угодно много времени. И только потом лавочку можно будет закрывать. Но пока что я буду праздновать эту промежуточную веху.
